1987 г. совместным решением Правительства Удмуртии и Президиума Уральского научного центра Академии наук был организован Удмуртский отдел социально-экономических исследований, преобразованный в 1995 г. в Удмуртский филиал Института экономики Уральского отделения РАН. На протяжении 33 лет филиал возглавлял Заслуженный деятель науки Российской Федерации, лауреат Государственной премии Удмуртской Республики Олег Иванович Боткин.

За годы функционирования Удмуртский филиал Института экономики УрО РАН вырос в научный центр комплексного исследования социально-экономических проблем и стратегических направлений развития региональной экономики, на постоянной основе осуществляющий анализ, оценку и прогнозирование современных трендов, а также научное обоснование преобразований в сферах экономической и социальной политики.

В настоящее время директором Удмуртского филиала ИЭ УрО РАН является д. э. н. А. В. Овчинникова. Под ее руководством коллектив филиала по-прежнему стремится сочетать высокий теоретический уровень анализа экономических проблем развития региона с решением практических задач.

В стенах филиала осуществлялись исследования по вопросам совершенствования территориального хозяйственного механизма, формирования регионального продовольственного рынка, рынка труда, финансово-бюджетной и промышленной политики, обеспечения экономической безопасности территорий, развития оборонно-промышленного комплекса и АПК, структурных и институциональных изменений в экономике. Наряду с тематикой государственного задания, филиал принимал участие в грантовых проектах Института экономики УрО РАН.

Результаты научных исследований сотрудников филиала отражены более чем в 80 авторских и коллективных монографиях. Ежегодно публикуются научные статьи в журналах Scopus, WoS, ВАК. Поддерживается высокий уровень наукометрических показателей в Российском индексе научного цитирования.

Под научным руководством сотрудников Удмуртского филиала Института экономики УрО РАН подготовлено и защищено 23 докторских и более 120 кандидатских диссертаций. Особое внимание уделялось подготовке национальных кадров.

Наряду с теоретико-методологическими разработками Удмуртский филиал Института экономики проводит исследования по прикладной 

тематике, реализуя совместные проекты с исполнительными органами государственной власти региона.

Сотрудничество Удмуртского филиала Института экономики УрО РАН и Правительства Удмуртской Республики связано с разработкой концепций, стратегий и программ регионального развития, в частности: Концепции социально-экономического развития Удмуртской Республики на 2010–2014 гг., Федеральной целевой программы социально-экономического развития Удмуртии на 1997–2000 гг., программ социально-экономического развития Удмуртской Республики на 2001–2004 гг., 2005–2009 гг. и 2010–2014 гг., Стратегии развития Удмуртской Республики до 2025 г.

Выполнены работы по заказам администраций городов и районов республики, а также хозяйствующих субъектов.

Для координации научно-исследовательской деятельности, объединения усилий ученых и практиков в решении наиболее сложных проблем регионального развития Удмуртский филиал Института экономики организует и проводит научно-практические мероприятия регионального и межрегионального уровней с активным привлечением представителей министерств, ведомств и институтов развития.

В рамках регионального сотрудничества подписано соглашение с Удмуртским машиностроительным кластером, организовано взаимодействие в области акселерационных программ Центра поддержки экспорта УР. Подготовлены анализ текущего состояния экспорта и долгосрочный прогноз развития экспортной деятельности в Удмуртской Республике, разработана Стратегия развития туристско-рекреационного кластера «Камский берег» до 2025 г.

Научный коллектив пополнился молодыми учеными, изучающими проблематику экономического развития предприятий, интеграционные процессы в региональном АПК и роль предпринимательских экосистем в развитии региональной экономики. В настоящее время в Удмуртском филиале ИЭ УрО РАН работают 12 ученых, в том числе 5 докторов экономических наук и 2 кандидата экономических наук. Доля молодых ученых составляет 27%.

В 2021 г. Министерством науки и высшего образования РФ для филиала утверждена новая тема исследований «Методология инновационного развития регионально-ориентированных производственных систем в условиях нестабильной экономической конъюнктуры», соответствующая новейшим запросам экономики знаний и тенденциям инновационного развития.